مهمترین وظیفه این واحد، حفاظت و نگهداری از فرشها است که به شکل علمی در انباری مجهز به روشهای نوین نگهداری فرشهای نفیس انجام می شود. روند انبار کردن فرش چندین مرحله را شامل می شود که از جمله آن می توان به موارد ذیل اشاره کرد:
1- ثبت اطلاعات فرش (ابعاد و کیفیت)
2- غبار روبی
3- بارکد گذاری
4- استفاده از مواد طبیعی دفع حشرات و جوندگان
5- پوشاندن فرش با لایه ای جنس سلفون
6- پوشاندن فرش با پارچه کتانی
شایان ذکر است موزه اشیای نفیس و نسخ خطی الکفیل از نخستین موزه هایی است که در عتبات مقدسه عراق گشایش یافته است. این موزه که در سال 2009 میلادی همزمان با میلاد خجسته حضرت زینب (عليها السلام) افتتاح شد، دربرگیرنده تعداد بسیاری از اشیای گرانبها و تاریخی است که قدمت برخی از آنها به صدها سال پیش باز می گردد.